Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms