Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms