Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLIP2Q9UDT6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms