Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms