Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms