Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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