Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms