Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008592.3-201ENST00000514941 418 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WFDC13-201ENST00000305479 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356273.1-201ENST00000441261 1152 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms