Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms