Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC8Q9BY41 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms