Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms