Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms