Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SALL3Q9BXA9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms