Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms