Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms