Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms