Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP4Q96P64 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms