Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms