Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL15Q96M94 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms