Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SAMD8Q96LT4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SAMD8Q96LT4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SAMD8Q96LT4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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SAMD8Q96LT4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAMD8Q96LT4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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