Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP47Q96K76 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms