Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECHDC3Q96DC8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECHDC3Q96DC8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ECHDC3Q96DC8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ECHDC3Q96DC8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ECHDC3Q96DC8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECHDC3Q96DC8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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