Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms