Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms