Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTC29Q8NA56 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTC29Q8NA56 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms