Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLIP4Q8N3C7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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