Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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C9orf40Q8IXQ3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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