Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT28Q7Z3Y7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms