Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms