Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms