Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms