Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A1Q6PCB7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms