Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms