Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms