Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GARNL3Q5VVW2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms