Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITRM1Q5JRX3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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