Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms