Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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