Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms