Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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