Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms