Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms