Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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