Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR3Q13615 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms