Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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