Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms