Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR1H3Q13133 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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NR1H3Q13133 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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