Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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