Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRJQ12913 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRJQ12913 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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