Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms